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JACS | 隱秘的乙酰化中間體—Aspirochlorine生物合成過程中硫遷移和手性螺縮醛胺形成

摘要

ETPs (Epidithiodiketopiperazines) 類天然產(chǎn)物是一類由真菌產(chǎn)生的次級代謝產(chǎn)物,其骨架特征是以含硫橋的二酮哌嗪為母核。Aspirochlorine具有抗菌和抗病毒活性,結(jié)構(gòu)中含有二硫鍵并與螺環(huán)體系相連。本文報道首例催化基序?yàn)?/span>CXXH的新型氧化還原酶 (AclR),可催化碳-硫鍵遷移和螺環(huán)形成,黃素腺嘌呤二核苷酸FAD起到蛋白質(zhì)折疊的支持作用,而非作為氧化還原輔因子。此外,隱秘的乙?;^程是其重排的先決條件。




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內(nèi)容

作者先前在米曲霉的基因組中鑒定了Aspirochlorine的生物合成基因簇(更多此類化合物的生物合成見文末往期推薦)。

 

Angewandte Chemie 126.49 (2014): 13627-13631.
 

本文重點(diǎn)在鑒定螺環(huán)結(jié)構(gòu)形成的基因。GliT催化gliotoxin生物合成中二硫鍵的氧化形成(1)。通過序列比對、測序等方法鑒定出硫氧還蛋白氧化還原酶aclR。隨后作者對野生型(AOKW2)和ΔaclR/ AOKW2LC-HRMS數(shù)據(jù)進(jìn)行比較分析,發(fā)現(xiàn)含有乙?;幕衔?/span>2可能作為螺環(huán)形成的前體(2)。

 
 

Figure 1. Chemical structures and molecular basis of the ETP toxins gliotoxin and aspirochlorin.
 

Figure 2. Identification and chemical characterization of the biosynthetic precursor of the spiroaminal product.
 

螺縮醛胺前體的分離和結(jié)構(gòu)測定。在時程分析中,作者觀察到化合物3通過逆向羥醛裂解轉(zhuǎn)化為43)。

 

Figure 3. In vitro reconstitution of AclR-catalyzed sulfur migration and spiro ring formation.

 

AclR的晶體結(jié)構(gòu)和特定位點(diǎn)的突變揭示了CXXH基序在催化反應(yīng)中的作用。作者解析AclR的晶體結(jié)構(gòu)(4A)。AclR中的特征催化基序?yàn)?/span>CXXHHis147與黃素雜環(huán)平行且緊密相鄰(3.5?),形成π-π作用而錨定(4B)。

 

Figure 4. Crystal structure of AclR and role of the specialized catalytic CXXH motif.
 

反應(yīng)機(jī)理如5所示。路徑His147奪取苯酚的氫生成酚鹽,通過5-exo-trig 型氫酰胺化反應(yīng)合成呋喃環(huán)。路徑bCys144在底物和酶之間生成分子間二硫鍵從而產(chǎn)生硫醇鹽陰離子,在脫乙酰氧基后形成噻喃烷中間體,隨后酰胺氮作為電子供體進(jìn)行12-磺胺基遷移。

 

Figure 5. Model of aspirochlorine biosynthesis with focus on spiroaminal formation catalyzed by AclR.
 

本文作者探討了AclR的催化機(jī)理,His147作為關(guān)鍵催化殘基之一,AclR可能通過C147H進(jìn)化突變形成手性螺縮醛胺,并且隱秘的乙?;^程是其重排的先決條件。AclR的出現(xiàn)豐富了真菌代謝產(chǎn)物的化學(xué)復(fù)雜性(圖6)。

 

Figure 6. Evolutionary relationship of canonical and noncanonical thioredoxin oxidoreductases in microbial biosynthesis.




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