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JACS | 隱秘的乙?;虚g體—Aspirochlorine生物合成過程中硫遷移和手性螺縮醛胺形成

摘要

ETPs (Epidithiodiketopiperazines) 類天然產(chǎn)物是一類由真菌產(chǎn)生的次級代謝產(chǎn)物,其骨架特征是以含硫橋的二酮哌嗪為母核。Aspirochlorine具有抗菌和抗病毒活性,結構中含有二硫鍵并與螺環(huán)體系相連。本文報道首例催化基序為CXXH的新型氧化還原酶 (AclR),可催化碳-硫鍵遷移和螺環(huán)形成,黃素腺嘌呤二核苷酸FAD起到蛋白質折疊的支持作用,而非作為氧化還原輔因子。此外,隱秘的乙?;^程是其重排的先決條件。




02


內容

作者先前在米曲霉的基因組中鑒定了Aspirochlorine的生物合成基因簇(更多此類化合物的生物合成見文末往期推薦)。

 

Angewandte Chemie 126.49 (2014): 13627-13631.
 

本文重點在鑒定螺環(huán)結構形成的基因。GliT催化gliotoxin生物合成中二硫鍵的氧化形成(1)。通過序列比對、測序等方法鑒定出硫氧還蛋白氧化還原酶aclR。隨后作者對野生型(AOKW2)和ΔaclR/ AOKW2LC-HRMS數(shù)據(jù)進行比較分析,發(fā)現(xiàn)含有乙?;幕衔?/span>2可能作為螺環(huán)形成的前體(2)。

 
 

Figure 1. Chemical structures and molecular basis of the ETP toxins gliotoxin and aspirochlorin.
 

Figure 2. Identification and chemical characterization of the biosynthetic precursor of the spiroaminal product.
 

螺縮醛胺前體的分離和結構測定。在時程分析中,作者觀察到化合物3通過逆向羥醛裂解轉化為43)。

 

Figure 3. In vitro reconstitution of AclR-catalyzed sulfur migration and spiro ring formation.

 

AclR的晶體結構和特定位點的突變揭示了CXXH基序在催化反應中的作用。作者解析AclR的晶體結構(4A)。AclR中的特征催化基序為CXXH,His147與黃素雜環(huán)平行且緊密相鄰(3.5?),形成π-π作用而錨定(4B)。

 

Figure 4. Crystal structure of AclR and role of the specialized catalytic CXXH motif.
 

反應機理如5所示。路徑His147奪取苯酚的氫生成酚鹽,通過5-exo-trig 型氫酰胺化反應合成呋喃環(huán)。路徑bCys144在底物和酶之間生成分子間二硫鍵從而產(chǎn)生硫醇鹽陰離子,在脫乙酰氧基后形成噻喃烷中間體,隨后酰胺氮作為電子供體進行12-磺胺基遷移。

 

Figure 5. Model of aspirochlorine biosynthesis with focus on spiroaminal formation catalyzed by AclR.
 

本文作者探討了AclR的催化機理,His147作為關鍵催化殘基之一,AclR可能通過C147H進化突變形成手性螺縮醛胺,并且隱秘的乙酰化過程是其重排的先決條件。AclR的出現(xiàn)豐富了真菌代謝產(chǎn)物的化學復雜性(圖6)。

 

Figure 6. Evolutionary relationship of canonical and noncanonical thioredoxin oxidoreductases in microbial biosynthesis.




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