分享一篇發(fā)表在Nature Chemical Biology上的文章,Peroxisomal-derived ether phospholipids link nucleotides to respirasome assembly,通訊作者是來(lái)自哈佛醫(yī)學(xué)院的Pere Puigserver教授,其課題組主要從事線粒體生物學(xué)以及代謝相關(guān)過程的生物學(xué)研究。
線粒體是真核生物進(jìn)行有氧呼吸的主要場(chǎng)所,通過電子傳遞鏈將電子給予氧氣分子,并在該過程中產(chǎn)生大量能量。電子傳遞鏈由線粒體內(nèi)的多個(gè)蛋白復(fù)合物組成;前人的研究表明,組成電子傳遞鏈的蛋白會(huì)相互之間形成超復(fù)合物(supercomplex, SC),并提高電子傳遞的效率;這種SC的組裝受到蛋白的調(diào)控,如已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的SC組裝因子1(SCAF1),然而,SC可以在缺乏SCAF1的情況下進(jìn)行組裝,這意味著可能有其它蛋白調(diào)控SC的組裝。此外,SC的組裝也受線粒體磷脂環(huán)境的調(diào)控;有研究表明,線粒體內(nèi)膜的磷脂酰乙醇胺(PE)和心磷脂(CI)是SC組裝所必須的,然而有關(guān)磷脂環(huán)境如何調(diào)控SC的組裝仍是未知的。為了探究這一問題,作者設(shè)計(jì)了一種互補(bǔ)式的納米熒光素酶(nanoluciferase,NanoLuc)來(lái)報(bào)告SC的組裝;該方法將熒光素酶切分為兩部分,將這兩部分分別連接在SC中不同蛋白的接觸界面上,當(dāng)SC組裝,則兩部分重新相遇、拼接,并產(chǎn)生熒光信號(hào)。
作者在測(cè)試了上述方法可行之后,對(duì)已注釋的蛋白靶標(biāo)文庫(kù)中的4,703種化合物進(jìn)行了高通量的篩選,找到了一組顯著影響SC組裝的子集,該子集為二氫乳清酸脫氫酶(DHODH)的抑制劑,如Vidofludimus等。DHODH是從頭合成嘧啶的限速酶。為了研究嘧啶代謝對(duì)SC組裝的作用,作者進(jìn)行了代謝組學(xué)的研究,表明了嘧啶的消耗會(huì)促進(jìn)SC的組裝,其中嘧啶合成的直接抑制劑的這種作用最明顯。進(jìn)一步地,作者還測(cè)試了外源嘧啶的添加對(duì)于DHODH已經(jīng)被抑制的細(xì)胞中SC組裝的作用。作者發(fā)現(xiàn),外源添加尿嘧啶可以將DHODH抑制組的熒光回調(diào)至于非抑制組相當(dāng)?shù)乃?,表明嘧啶?duì)于SC的組裝有抑制作用。通過進(jìn)一步的相關(guān)過程代謝組學(xué)的分析,表明DHODH抑制組通過嘧啶核苷酸下游的代謝產(chǎn)物減少來(lái)促進(jìn)SC的組裝。此外,作者對(duì)于線粒體內(nèi)膜的磷脂環(huán)境也做了研究,表明了在CTP缺乏時(shí),二?;?PC/PE的合成受阻,并補(bǔ)充PC/PE對(duì)應(yīng)的醚磷脂亞類以維持PC/PE水平。通過對(duì)過氧化物酶體衍生的醚磷脂合成的限速酶FAR1的研究表明,過氧化物酶體衍生的線粒體醚磷脂可以特異性誘導(dǎo)SC的組裝并提高其活性。
總之,作者設(shè)計(jì)了一種互補(bǔ)式的熒光蛋白酶來(lái)報(bào)告SC組裝的情況,并研究了其受調(diào)控的情況,表明SC的形成是對(duì)低核苷酸水平的一種代償性反應(yīng),通過形成SC來(lái)增加線粒體的呼吸能力,并驅(qū)動(dòng)細(xì)胞增殖。
本文作者:WZY
責(zé)任編輯:Guo ZH
原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41589-021-00772-z
文章引用:DOI:10.1038/s41589-021-00772-z