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網(wǎng)站首頁(yè)/有機(jī)動(dòng)態(tài)/有機(jī)前沿/諾丁漢大學(xué)Nat Catal | ?;D(zhuǎn)移酶三聯(lián)體突變實(shí)現(xiàn)硫酯合成并拓展底物反應(yīng)譜
諾丁漢大學(xué)Nat Catal | 酰基轉(zhuǎn)移酶三聯(lián)體突變實(shí)現(xiàn)硫酯合成并拓展底物反應(yīng)譜

01


摘要

生物催化的主要目標(biāo)之一是擴(kuò)展有機(jī)化學(xué)家可利用的酶促反應(yīng)工具箱。本文酰基轉(zhuǎn)移酶催化三聯(lián)體S11C突變擴(kuò)展了其合成能力,能夠有效催化硫酯和叔酰胺的合成。 使用乙烯基酯作為?;瘎?,以不同的硫醇和仲胺作為合成砌塊進(jìn)行了制備規(guī)模(250 mM)的生物轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)化率極高,并已成功應(yīng)用于乙酰輔酶A及其類似物的合成。




02


內(nèi)容

硫酯在?;D(zhuǎn)移反應(yīng)中作為重要的反應(yīng)供體,酰胺鍵是許多藥物的關(guān)鍵官能團(tuán),目前尚無(wú)合適的硫代酯和叔酰胺生物催化合成方法。MsAcT(來(lái)源于恥垢分枝桿菌)SGNH絲氨酸水解酶超家族具有共同的特征,其中包括催化三聯(lián)體(Ser-His-Asp),該三聯(lián)體在進(jìn)化上十分保守。在典型的?;D(zhuǎn)移酶機(jī)理中,催化三聯(lián)體促使形成?;钢虚g體(acyl-O-Ser-enzyme),該中間體對(duì)于親核試劑反應(yīng)性較弱。將催化氨基酸絲氨酸突變?yōu)榘腚装彼釋a(chǎn)生更具反應(yīng)性的acyl-S-Cys-enzyme,不僅有助于通過(guò)Cys-S-消除,而且可以通過(guò)氧陰離子穴中的氫鍵來(lái)實(shí)現(xiàn)。但是,這種絲氨酸水解酶催化三聯(lián)體中的Ser / Cys交換大大降低水解其活性。本文作者將?;D(zhuǎn)移酶的催化氨基酸Ser突變?yōu)?/span>Cys以擴(kuò)大其在水性介質(zhì)中的合成能力。 S11C突變體表現(xiàn)出對(duì)巰基以及仲胺更寬泛的底物范圍。以一種綠色的方式合成硫酯和叔酰胺,例如可以合成乙酰輔酶A(乙酰輔酶A)及其類似物。

硫酯的合成。使用2-苯基乙硫醇(1a)作為模式底物,通過(guò)探查S11C MsAcT底物范圍進(jìn)一步建立了由S11C MsAcT催化的硫酯合成(1)。


 

與野生型不同,S11C MsAcT不接受乙酸乙酯作為?;w,因?yàn)樗闯浞只罨?。用兩種選定的硫醇(1a1b)進(jìn)一步研究了對(duì)不同乙烯基酯供體的反應(yīng)性(2)。

 


輔酶A類似物N-乙酰半胱胺(HS-NA , 1o)可用來(lái)合成輔酶A硫酯(1)。

 


Fig. 1 | Biosynthesis of acetyl-CoA and its mimetics.
 

通過(guò)計(jì)算研究深入了解乙酰輔酶A及其模擬物的結(jié)合,當(dāng)硫酯羰基氧在距Cys11的催化距離處指向氧陰離子孔時(shí),乙酰輔酶A顯示出最佳分?jǐn)?shù)(2)。

 

Fig. 2 | Docking of acetyl-CoA.
 

為研究輔酶A向活性位點(diǎn)的轉(zhuǎn)運(yùn)以及乙酰輔酶A沿相反方向的出口,使用CaverDock軟件計(jì)算底物在其到達(dá)活性腔的路徑中的能量分布(3)以及在相反方向上的產(chǎn)物。CoA傾向于腺嘌呤首先進(jìn)入活性腔,從而最終觀察到結(jié)構(gòu)的翻轉(zhuǎn)。

 

Fig. 3 | CoA and acetyl-CoA computational studies.

 

叔酰胺的合成。使用乙酸乙烯酯作為供體測(cè)試了一系列仲胺和環(huán)胺(250mM)(3),證明了S11C MsAcT的多功能性。

 


MsAcT S11C的立體選擇性。野生型 MsAcT對(duì)選定的底物僅表現(xiàn)出中等的對(duì)映選擇性。因此,使用乙酸乙烯酯作為供體,使用支鏈親核試劑(表4,1-7)和α-取代的環(huán)狀仲胺(表4,8-10)評(píng)估MsAcT S11C4)。

 


總而言之,本項(xiàng)研究打破了酶工程學(xué)的規(guī)則開發(fā)出一種新的化學(xué)反應(yīng)方法。為了改變酶的底物范圍,突變通常是涉及底物識(shí)別中的關(guān)鍵殘基,無(wú)論是通過(guò)合理的設(shè)計(jì)還是通過(guò)定向進(jìn)化,始終保持催化殘基不變。本文?;D(zhuǎn)移酶催化三聯(lián)體S11C突變能夠轉(zhuǎn)化野生型無(wú)法接受的底物類型并用來(lái)合成叔酰胺和硫酯,可以在溫和的條件下合成具有挑戰(zhàn)性的分子(如乙酰輔酶A)實(shí)現(xiàn)大規(guī)模轉(zhuǎn)化,最終實(shí)現(xiàn)模擬細(xì)胞代謝。



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