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Angew. Chem. | 新型無痕切割的仲氨基醇linker

給大家分享一篇Angewandte上的一篇文章,“Secondary Amino Alcohols: Traceless Cleavable Linkers for Use in Affinity Capture and Release”,本文的通訊作者來自麻省理工學(xué)院化學(xué)系的Bradley L. Pentelute教授,該課題組的研究方向?yàn)樘剿髁诵碌陌腚装彼岷唾嚢彼岱蓟瘜W(xué)物質(zhì),用于蛋白質(zhì)的高效和選擇性修飾,發(fā)明新的化學(xué)方法來修飾蛋白質(zhì),以增強(qiáng)其對人類醫(yī)學(xué)的治療性能,同時(shí)還致力于將大生物分子傳遞到細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中。

      合成肽庫目前被廣泛運(yùn)用于尋找蛋白質(zhì)靶標(biāo)結(jié)合的序列或者具有細(xì)胞穿透能力的序列。而合成肽庫的特定序列的多肽需要從生物樣品中進(jìn)行選擇性捕獲并進(jìn)行釋放,并且用LC-MS / MS分析分離的肽確定其序列。事實(shí)上,目前廣泛采用的鏈霉親和素-生物素親和力捕獲和釋放方法存在釋放定量不準(zhǔn)確的問題。為了釋放生物素化的肽,需要變性條件(例如在SDS中進(jìn)行煮沸),這可能導(dǎo)致降解和污染。 因此,需要在用鏈霉親和素捕獲后有效釋放多肽的新方法。

      可切割的linker是一種親和力捕獲后釋放肽的有效方法。需要滿足兩方面的條件:1)能夠摻入肽中,2)在特定條件下裂解。目前已經(jīng)報(bào)道各種可切割的linker,可以通過酶,光照,金屬,親核試劑,親電試劑,酸,還原劑,氧化劑等方法來誘導(dǎo)切割。其中,基于鄰二醇的linker與標(biāo)準(zhǔn)固相肽合成(SPPS)兼容而受到廣泛的關(guān)注。1,2-二醇基序?qū)A性和酸性條件穩(wěn)定,而用高碘酸鈉處理linker嵌入的肽則可以切割。氨基醇是一種高碘酸不穩(wěn)定的替代基序,其裂解速度比二醇快1000倍。然而,該linker需要九步的合成步驟,存在其廣泛的使用的瓶頸。

      因此,本文報(bào)道仲氨基醇是一類新的可氧化裂解的linker。在小分子研究中,仲氨基醇對NaIO4氧化表現(xiàn)出與伯氨基醇相同的反應(yīng)性。作者基于絲氨酸(seramox)和異絲氨酸(isoseramox)設(shè)計(jì)了兩個(gè)具有該基序的可裂解連接子。這些結(jié)構(gòu)可以在SPPS過程中通過還原胺化插入到肽主鏈中。同時(shí),兩種linker都可以在數(shù)分鐘內(nèi)被高碘酸鹽定量裂解。而isoseramox在切割后釋放天然肽N-末端;這是無痕高碘酸鹽可裂解連接子的第一個(gè)例子。

      基于isoseramox 在無痕方面的表現(xiàn),作者將其引入到具有216個(gè)肽的合成肽庫中,以測試(1)在幾個(gè)N末端殘基上的添加效率,以及(2)在存在多種氨基酸側(cè)鏈的情況下其氧化裂解的耐受性。作者在沒有(文庫A)和有(文庫B)isoseramox的情況下合成多種肽庫,文庫A從樹脂上切割并分離,文庫B綴合至生物素,從樹脂上裂解,用抗生蛋白鏈菌素磁珠拉下,并用NaIO4裂解。在兩種情況下,均使用nanoLC-MS對兩個(gè)文庫進(jìn)行了測序,回收率均> 90%。這突顯了isoseramox linker的摻入和裂解可耐受大多數(shù)類型的氨基酸,具有廣泛的底物耐受性。

      Isoseramox linker也與基于細(xì)胞的測定體系兼容。在篩選全細(xì)胞的肽結(jié)合劑或細(xì)胞穿透肽(CCP)時(shí),通常需要從細(xì)胞中回收肽。而作者也證明了Isoseramox linker可用于從HeLa細(xì)胞中回收CPP。作者合成了CPP D-滲透素,其中包含生物素,和Isoseramox linker。其結(jié)果顯示NaIO4處理磁珠可以回收3ng D-滲透素,這結(jié)果Isoseramox linker在未來基于細(xì)胞的肽文庫篩選中的應(yīng)用潛力,同時(shí)作者含D-戊二烯的異黃酮保留其穿透細(xì)胞的活性。

      總之,本文作者證實(shí)仲氨基醇Isoseramox linker可以作為一類新的可裂解的連接子,對肽文庫篩選具有廣泛的適用性。


本文作者:LSC

文章地址:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/anie.202003478

文章引用:Angew. Chem. Int. Ed. 10.1002/anie.202003478


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