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【Nat. Chem. Biol.】全基因組篩選發(fā)現(xiàn)KDM2B參與蛋白質(zhì)與硫酸乙酰肝素的結(jié)合
硫酸乙酰肝素(HS)蛋白多糖結(jié)合胞外蛋白參與細(xì)胞信號傳導(dǎo)、附著和內(nèi)吞作用。這些相互作用依賴于硫酸化糖在HS鏈中的排列,HS鏈由具有良好特性的生物合成酶產(chǎn)生;然而,這些酶的調(diào)控在很大程度上是未知的。近期,美國加州大學(xué)圣地亞戈分校Jeffrey D. Esko組利用一個小分子配體結(jié)合HS進(jìn)行了全基因組CRISPR-Cas9篩選。對A375黑色素瘤細(xì)胞的篩選發(fā)現(xiàn)了影響HS形成的額外的基因和途徑。

圖片來源:Nat. Chem. Biol.

 


通過篩選后發(fā)現(xiàn),表觀遺傳因子KDM2B,一種組蛋白去甲基酶,它失活會抑制多種HS-硫轉(zhuǎn)移酶并上調(diào)硫酸酯酶SULF1。這些變化對HS結(jié)合蛋白的相互作用有不同的影響。


圖片來源:Nat. Chem. Biol.

 

KDM2B缺陷細(xì)胞的生長率下降,這是由SULF1失活挽救。此外,KDM2B缺失改變了許多細(xì)胞外基質(zhì)基因的表達(dá)。因此,KDM2B通過調(diào)節(jié)HS結(jié)構(gòu)控制A375細(xì)胞的增殖,并作為細(xì)胞外基質(zhì)的主要調(diào)節(jié)因子。


圖片來源:Nat. Chem. Biol.

 

參考文獻(xiàn):Genome-wide screens uncover KDM2B as a modifier of protein bindingto heparan sulfate

Nat. Chem. Biol.

DOI: 10.1038/s41589-021-00776-9

原文作者:Ryan J. Weiss, Philipp N. Spahn, Nathan E. Lewis? and Jeffrey D. Esko? et al.


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