肽是一類快速發(fā)展的治療藥物，與傳統(tǒng)的小分子藥物相比具有許多優(yōu)點(diǎn)，尤其是在靶向困難的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用方面。然而，目前基于結(jié)構(gòu)的設(shè)計(jì)方法主要局限于天然肽，不適合設(shè)計(jì)超越天然L-氨基酸的具有生物活性的環(huán)狀拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。
近期，巴塞羅那科學(xué)技術(shù)學(xué)院Ernest Giralt組報(bào)告了一個(gè)可推廣的框架，利用Rosetta的計(jì)算能力，在大規(guī)模骨架樣品、側(cè)鏈組成和能量評(píng)分方面，設(shè)計(jì)與蛋白質(zhì)表面結(jié)合的雜環(huán)肽。為了展示該方法的適用性，我們開發(fā)了兩種新的程序性細(xì)胞凋亡1（PD-1）抑制劑（PD-i3和PD-i6），PD-1是腫瘤學(xué)中一個(gè)關(guān)鍵的免疫檢查點(diǎn)。
圖片來(lái)源：Chem. Sci.
對(duì)PD-i3和PD-i6進(jìn)行了全面的生物物理評(píng)估，以評(píng)估它們與PD-1的結(jié)合以及它們對(duì)內(nèi)源性PD-1/PD-L1相互作用的阻斷作用。
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最后，核磁共振對(duì)其溶液結(jié)構(gòu)的解析證實(shí)了這種從頭設(shè)計(jì)方法。
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參考文獻(xiàn)：Target-templated de novo design of macrocyclic D-/L-peptides:discovery of drug-like inhibitors of PD-1
Chem. Sci.
DOI：10.1039/d1sc01031j
原文作者：Salvador Guardiola, * Monica Varese, Xavier Roig, Macarena Sánchez-Navarro, Jesús García and Ernest Giralt *
