本文主要介紹由默克的科學(xué)家發(fā)現(xiàn)的一種新型多功能試劑,可實(shí)現(xiàn)吡啶直接轉(zhuǎn)化為Boc-保護(hù)的2-氨基吡啶,具有出色的位點(diǎn)選擇性和化學(xué)選擇性。同時(shí),該新型試劑僅需一步制備,并實(shí)現(xiàn)200克規(guī)模的放大。此外,胺化反應(yīng)條件溫和,不受空氣或濕氣的影響,并具有良好的官能團(tuán)耐受性(J. Am. Chem. Soc. 2020, 142, 8614-8618)。

新型多功能試劑2的合成操作(200 g):

在10 L的四口燒瓶中加入5,6二氯吡嗪-2,3-二甲腈(400.00 g,2010.2 mmol,1.00 eq),BocNHOH(294.41 g,2211.2 mmol,1.10eq)和THF(4.0 L)后,冷卻至-20℃,并在30min內(nèi)滴加Et3N(223.75g,2211.2mmol,1.10eq)。將所得溶液在-20℃下攪拌10min,過(guò)濾后濃縮濾液,通過(guò)硅膠上純化后,將粗產(chǎn)物溶解在DCM(3 mL/g)中,緩慢加入己烷(12 mL/g)作為反溶劑,形成結(jié)晶2,再用己烷洗滌和干燥,得到2(205g,35%),為白色固體。
4a的合成操作:

向反應(yīng)瓶中加入吡啶底物(3,1.0 eq),N,O-雙三甲硅基乙酰胺(3.0 eq)和無(wú)水二惡烷(4mL),隨后加入2(1.5 eq),將其密封在80℃加熱3小時(shí)。將反應(yīng)混合物冷卻至室溫,用冰AcOH(4mL)稀釋,并立即加入Zn粉(5.0 eq),所得的漿液在室溫下劇烈攪拌3小時(shí),將混合物濃縮至干,并將產(chǎn)物在硅膠上純化。
正文:
吡啶作為藥物、農(nóng)用化學(xué)品以及天然產(chǎn)物中的關(guān)鍵骨架,已開(kāi)發(fā)出多種方法用于吡啶的修飾。如Minisci型自由基加成反應(yīng)可引入碳鍵,同時(shí)也可通過(guò)吡啶N-氧化物或N-活化的吡啶鎓化合物引入碳或雜原子。然而,為了避免在吡啶N-氧化物化學(xué)反應(yīng)中使用強(qiáng)氧化劑和活化劑,并在自由基反應(yīng)中超越固有的位點(diǎn)選擇性,因此,仍需開(kāi)發(fā)一種新型吡啶位點(diǎn)選擇性的官能化方法。
在已知含吡啶結(jié)構(gòu)的生物活性化合物中,2-氨基吡啶作為所有治療領(lǐng)域的化合物中發(fā)現(xiàn)的優(yōu)先藥效團(tuán)。具查閱,2019年FDA批準(zhǔn)的小分子的療法中,在32種藥物中有8種包含此類骨架(25%),其中包含2-氨基吡啶(5種)或2-氨基二嗪化合物(3種)(Figure 1)。因此,鑒于2-氨基吡啶的重要性,與吡啶N-氧化物和相關(guān)化學(xué)有關(guān)的挑戰(zhàn),以及Chichibabin反應(yīng)的苛刻條件等,因此,需開(kāi)發(fā)一種可將吡啶直接轉(zhuǎn)化為2-氨基吡啶的條件,該條件可用于藥物樣分子的功能化。具體而言,吡啶無(wú)需預(yù)活化,不受空氣或濕氣的影響,以出色的位點(diǎn)選擇性直接進(jìn)行反應(yīng),同時(shí)能夠耐受藥物樣分子中常見(jiàn)的官能團(tuán),并產(chǎn)生廢物最少,純化需簡(jiǎn)單,試劑廉價(jià)易得等。

基于上述的討論,本文著手開(kāi)發(fā)一種可將吡啶轉(zhuǎn)化為2-氨基吡啶的通用方法。最初,作者使用本課題組前期開(kāi)發(fā)的雙功能試劑1(既充當(dāng)吡啶環(huán)的活化劑,又充當(dāng)N-O鍵斷裂的溫和雙電子氧化劑)用于吡啶的反應(yīng)(Figure 2A)。然而,在對(duì)多種基于氮的親核試劑和雙功能試劑庫(kù)的篩選中,均未檢測(cè)到目標(biāo)產(chǎn)物。通常,親核試劑在肟碳上發(fā)生進(jìn)攻或氨基中間體發(fā)生開(kāi)環(huán)。為了避免該途徑,作者設(shè)計(jì)并測(cè)試了幾種新型試劑,(i)與吡啶反應(yīng)形成反應(yīng)性吡啶鎓鹽,(ii)提供氮親核試劑的分子內(nèi)傳遞,(iii)直接將官能化直接作用于C-2,(iv)防止開(kāi)環(huán),并最終通過(guò)N-O鍵斷裂促進(jìn)雙電子氧化/芳構(gòu)化。
在對(duì)幾種新型的雙功能試劑篩選中(Figure 2B),由于在同一分子中存在親核試劑和親電試劑而不穩(wěn)定,或沒(méi)有促進(jìn)所需的反應(yīng)。最后,作者通過(guò)將活化基團(tuán)從氧代氯酰氯改變?yōu)槿彪娮拥穆冗拎海㈦p電子氧化劑轉(zhuǎn)化為親核氮試劑,最終形成了試劑2(Figure 2C)。具體反應(yīng)過(guò)程涉及吡啶活化,氮親核試劑分子內(nèi)的傳遞,通過(guò)N-O鍵斷裂和互變異構(gòu)進(jìn)行的重新芳構(gòu)化,最終吡嗪的斷裂,即可獲得目標(biāo)產(chǎn)物(Figure 2D)。


首先,作者以吡啶3a與2作為模型底物,進(jìn)行C-2胺化的條件研究。盡管典型的無(wú)機(jī)或有機(jī)堿導(dǎo)致2的分解(eq 1),但N,O-雙三甲硅基乙酰胺(BSA)通過(guò)生成TMSC1清除HCl,從而促進(jìn)了所需的反應(yīng)。吡啶與2(1.5當(dāng)量)和BSA(3當(dāng)量)在二惡烷中在80℃下反應(yīng),在3 h后以幾乎定量的產(chǎn)率形成吡嗪產(chǎn)物。隨后,在強(qiáng)烈條件下(6M HCl,回流),酸介導(dǎo)的水解作用可裂解加成物并除去Boc基團(tuán),但苛刻的條件不切實(shí)際。最后發(fā)現(xiàn),可在溫和的還原條件(Zn+AcOH)下促進(jìn)裂解,從而以高收率形成2-NHBoc吡啶產(chǎn)物4a。

同時(shí),試劑2也易制備,通過(guò)市售5,6-二氯吡嗪-2,3-二碳腈($1.35/mmol)和NBoc羥胺($0.05/mmol)制備大于200 g試劑2。根據(jù)DSC分析,純化的2是結(jié)晶的,在空氣中無(wú)限穩(wěn)定,并且在固態(tài)至126℃的溫度下具有熱穩(wěn)定性(eq 2)。

隨后,作者對(duì)吡啶的范圍進(jìn)行了研究(Scheme 1)。當(dāng)在吡啶環(huán)的4-位上具有醇、羧酸、磺酰胺、酰胺、吲哚、酚、硫醚、酯、醛等的官能團(tuán)均耐受,獲得產(chǎn)物4a-4l。然而,對(duì)于3-取代的吡啶底物,可選擇性地發(fā)生官能化以形成2,3-或2,5-二取代的產(chǎn)物4m-4s。具有3-氟,3-溴或3-甲氧基取代基的吡啶底物優(yōu)先形成2,3-二取代的產(chǎn)物。具有較大的官能團(tuán),如(雜)芳基、甲酯、三氟甲基、?;?,易形成2,5-二取代的產(chǎn)物。而喹啉僅生成1-NHBoc喹啉。


反應(yīng)以0.5mmol或5.0mmol的規(guī)模進(jìn)行時(shí),獲得相同收率的結(jié)果。此外,還以克級(jí)制備了含有Cbz或Ts基團(tuán)(代替Boc)的試劑2衍生體,并在標(biāo)準(zhǔn)條件下以高收率促進(jìn)了吡啶的C-2官能化(eq 3)。

為了進(jìn)一步了解反應(yīng)機(jī)理,作者進(jìn)行了相關(guān)的對(duì)照實(shí)驗(yàn)和光譜實(shí)驗(yàn)。首先,在吡啶和4-CO2Me吡啶之間進(jìn)行競(jìng)爭(zhēng)反應(yīng),大約20%的轉(zhuǎn)化率后表明,只有吡啶與2反應(yīng)形成吡啶-吡嗪加合物(eq 4),表明弱親核性吡啶反應(yīng)慢。而在標(biāo)準(zhǔn)條件下與2-氘代-4-苯基吡啶進(jìn)行反應(yīng),以測(cè)量分子內(nèi)KIE,在反應(yīng)結(jié)束時(shí),觀察到等摩爾量的CH和CD官能化產(chǎn)物(eq 5)。

為了進(jìn)一步了解反應(yīng)的過(guò)程,作者進(jìn)行了NMR光譜實(shí)驗(yàn)(Figure 3)。首先,在10min內(nèi),觀察到二氫吡啶類5與未反應(yīng)的吡啶混合物。在室溫下,二氫吡啶5通過(guò)堿介導(dǎo)的N鍵斷裂進(jìn)一步反應(yīng),大約90分鐘后達(dá)到完全轉(zhuǎn)化。發(fā)現(xiàn)最初提出的兩性離子結(jié)構(gòu)不正確,實(shí)際獲得產(chǎn)物6(包含一個(gè)OTMS基團(tuán)和一個(gè)去質(zhì)子化的NHBoc基團(tuán))。同時(shí),6可在80℃進(jìn)行異構(gòu)化,隨后吡啶氮與Boc保護(hù)的氮凈重排形成7。最后,將反應(yīng)混合物在乙酸-d4中進(jìn)行Zn介導(dǎo)的還原,從而獲得產(chǎn)物4a以及副產(chǎn)物8。

總結(jié):本文開(kāi)發(fā)了一種新型的多功能試劑,可將吡啶直接轉(zhuǎn)化為Boc保護(hù)的2-氨基吡啶。同時(shí),光譜實(shí)驗(yàn)表明,該反應(yīng)涉及吡啶的活化、N-O鍵斷、熱異構(gòu)化以及還原的過(guò)程。因此,該反應(yīng)可作為合成2-氨基吡啶的通用合成方法。













