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【Nat. Commun.】基于結(jié)構(gòu)的萜烯生物合成中的流水線催化機(jī)制
來(lái)源于Phomopsis amygdaliFusicoccadiene合酶(PaFS)是一種獨(dú)特的雙功能萜類(lèi)合酶,催化14-3-3蛋白質(zhì)相互作用的介體二萜糖苷FusicoccinA生物合成的前兩步。PaFS的異戊二烯基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域生成香葉酰二磷酸(GGPP),然后環(huán)化酶結(jié)構(gòu)域利用該結(jié)構(gòu)域生成FusicoccinA的三環(huán)烴骨架fusicoccadiene。

圖片來(lái)源:Nat. Commun.


近期,University of PennsylvaniaDavid W.Christianson組利用冷凍電鏡,解析了PaFS的晶體,該結(jié)構(gòu)由異戊二烯基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域的中心八聚體核心組成,八個(gè)環(huán)化酶結(jié)構(gòu)域通過(guò)可變張開(kāi)位置的柔性連接片段向外輻射。

圖片來(lái)源:Nat. Commun.

 

此外,冷凍電鏡和化學(xué)交聯(lián)實(shí)驗(yàn)還表明,環(huán)化酶結(jié)構(gòu)域與異戊二烯基轉(zhuǎn)移酶核心更密切相關(guān),可以實(shí)現(xiàn)緊湊的構(gòu)象。

圖片來(lái)源:Nat. Commun.

  

由于異戊二烯基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域產(chǎn)生的大多數(shù)香葉酰二磷酸保留在酶上,用于環(huán)化形成fusicoccadiene,因此,這一結(jié)構(gòu)分析為理解底物通道提供了一個(gè)框架。

 

參考文獻(xiàn):Structural insight on assembly-line catalysis in terpene biosynthesis

Nat. Commun.

DOI10.1038/s41467-021-23589-9

原文作者:Jacque L. Faylo, Trevor van Eeuwen, Hee Jong Kim, Jose J. GorbeaColón, Benjamin A. Garcia, Kenji Murakami & David W. Christianson?

 


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