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清華/復(fù)旦/天大Nature子刊:提高300倍!酶結(jié)合SACs破解催化難題

成果展示



將單個(gè)金屬原子錨定在酶上具有巨大的應(yīng)用潛力,其可以產(chǎn)生具有高活性和選擇性的混合催化劑,從而用于傳統(tǒng)金屬催化劑無(wú)法驅(qū)動(dòng)的反應(yīng)?;诖耍?strong>清華大學(xué)戈鈞教授、復(fù)旦大學(xué)Richard N. Zare和天津大學(xué)張麟教授(共同通訊作者)等人報(bào)道了一種光化學(xué)方法,并設(shè)計(jì)了一種共價(jià)結(jié)合的酶聚合物偶聯(lián)物,在聚合物鏈上產(chǎn)生與金屬單原子結(jié)合的碳自由基,以及酶表面的氨基酸。
通過(guò)在Candida antarctic lipase B(CALB)上錨定單個(gè)鈀(Pd)原子構(gòu)建的半異質(zhì)SACs(記為Pd1/CALB-P),Pd金屬質(zhì)量負(fù)載高達(dá)4.0%,同時(shí)保持Pd的原子分散,其可以高效的驅(qū)動(dòng)烷基-烷基交叉偶聯(lián)反應(yīng)(alkyl-alkyl cross-coupling reactions)。其中,烷基-烷基鍵的合成是有機(jī)合成中最重要的鍵結(jié)構(gòu)之一,在制藥、材料和能源工業(yè)中有著廣泛的應(yīng)用。烷基-烷基交叉偶聯(lián)反應(yīng)不能被原始的天然脂肪酶催化,而傳統(tǒng)的Pd催化劑只能在環(huán)境條件下以非常低的效率催化。
在文中,Pd1/CALB-P在水溶液中和反應(yīng)溫度為25 °C下,催化1-溴己烷和B-n-hexyl-9-BBN的烷基-烷基交叉偶聯(lián)反應(yīng)時(shí)轉(zhuǎn)化頻率(turnover frequency, TOF)達(dá)到540 h-1,是傳統(tǒng)催化劑Pd(OAc)2的300倍,密度泛函理論(DFT)計(jì)算發(fā)現(xiàn),脂肪酶活性位點(diǎn)作為支架有效地與烷基鏈結(jié)合,形成多種非共價(jià)相互作用,穩(wěn)定Pd-烷基鏈的過(guò)渡態(tài),降低活化能。此外,酶的選擇性結(jié)合為Pd催化提供了選擇性??傊?,原子分散的金屬催化劑與酶的結(jié)合帶來(lái)了許多設(shè)計(jì)催化劑的可能性,可以在環(huán)境條件下有效地催化難以實(shí)現(xiàn)的反應(yīng)。

背景介紹



原子分散的金屬催化劑因其最大的原子效率和獨(dú)特的催化性能,成為多相催化研究的一個(gè)熱門(mén)前沿領(lǐng)域。因此,亟需構(gòu)建具有高活性、選擇性和穩(wěn)定性的單原子催化劑(SACs),但是仍然面臨著巨大的挑戰(zhàn)性。將單個(gè)金屬原子錨定在酶上,理論上可以將酶催化、均相催化和多相催化結(jié)合起來(lái),為開(kāi)發(fā)在環(huán)境條件下高效運(yùn)行的混合催化劑提供了一個(gè)有前景的平臺(tái)。借助酶活性袋(enzyme active pocket)對(duì)反應(yīng)中間體的識(shí)別和結(jié)合能力,可以極大降低金屬催化反應(yīng)的活化能,從而大大提高金屬催化的效率和選擇性。將金屬單原子錨定在酶上,可以成為傳統(tǒng)金屬催化劑難以催化的反應(yīng)的理想催化劑。然而,酶與金屬單原子催化劑的結(jié)合尚未實(shí)現(xiàn),可能是因?yàn)榈鞍踪|(zhì)的靈活構(gòu)型和較差的結(jié)合能力而不能穩(wěn)定金屬單原子。

圖文解讀



合成與表征
作者通過(guò)光化學(xué)方法實(shí)現(xiàn)了Pd在酶聚合物偶聯(lián)物上的原子分散。具體而言,通過(guò)將酶與環(huán)氧丙烷和環(huán)氧乙烷的醛官能化三嵌段共聚物(Pluronic F-127)共價(jià)連接合成酶聚合物偶聯(lián)物。在對(duì)含有酶pluronic偶聯(lián)物、二苯甲酮(BP)和PdCl2的溶液進(jìn)行20 min的紫外線(xiàn)處理后,Pd原子被捕獲在酶pluronic偶聯(lián)物上。通過(guò)調(diào)整Pd錨定脂肪酶pluronic偶聯(lián)物(Pd1/CALB-P)合成中PdCl2的量,可將Pd的質(zhì)量負(fù)載控制在高達(dá)4.0%(w/w)范圍內(nèi),其中在每個(gè)CALB-P偶聯(lián)物上錨定了16個(gè)Pd單原子。

圖1. Pd1/CALB-P的制備與表征
穩(wěn)定機(jī)理研究
通過(guò)密度泛函理論(DFT)計(jì)算,計(jì)算了酶Pluronic偶聯(lián)物的六個(gè)潛在位點(diǎn)的結(jié)合能,這些位點(diǎn)可以提供兩個(gè)O原子與PdCl2配位,包括 Asp、Asn、Ser、Ser-Ser、Ser-Asp和PEO鏈。帶有負(fù)電荷羧基的Asp作為理想配體與PdCl2形成穩(wěn)定的四配位結(jié)構(gòu)。nanoESI-MS進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),Asp和Ser殘基最有可能是Pd單原子的結(jié)合位點(diǎn)。Pd單原子在酶上的穩(wěn)定化機(jī)制包括三個(gè)步驟:1)PdCl2與酶氨基酸殘基中的兩個(gè)O原子結(jié)合生成PdCl2/CALB-P;2)在紫外線(xiàn)照射下,從pluronic中提取H形成烷基自由基;3)兩個(gè)烷基自由基攻擊Pd原子,除去Cl離子生成Pd1/CALB-P。

圖2. Pd單原子在酶上的穩(wěn)定機(jī)制
催化性能
作者在25? °C水溶液中進(jìn)行烷基-烷基交叉偶聯(lián)反應(yīng),以評(píng)估Pd1/CALB-P的催化性能,其中Pd(OAc)2作為參考催化劑。在1-溴己烷和B-n-hexyl-9-BBN的偶聯(lián)中,Pd1/CALB-P顯示出比Pd(OAc)2高得多的活性。從初始活性計(jì)算,Pd1/CALB-P(33.8 h-1)的TOF是Pd(OAc)2(1.8 h-1)的19倍。同時(shí),Pd1/CALB-P 在10次催化循環(huán)后仍保持75%的活性,表明具有良好的可重復(fù)使用性?;诜治龊屠碚撚?jì)算,作者確定了Asp223是將Pd單原子錨定在酶活性位點(diǎn)上的最可能殘基,并計(jì)算出酶活性位點(diǎn)相鄰Pd原子的TOF值高達(dá)540 h-1,是Pd(OAc)2的300倍。

圖3. Pd1/CALB-P的催化性能

圖4. 分子動(dòng)力學(xué)模擬

文章信息



Cooperative catalysis by a single-atom enzyme-metal complex.Nature Communications2022, DOI: 10.1038/s41467-022-29900-6.

https://doi.org/10.1038/s41467-022-29900-6.


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