母乳低聚糖(HMO)由一組結(jié)構(gòu)復(fù)雜、未結(jié)合的聚糖組成,在母乳中含量非常豐富。它們在確定嬰兒腸道微生物群方面發(fā)揮著關(guān)鍵作用,為嬰兒提供了抵抗感染的保護(hù)屏障、免疫調(diào)節(jié)作用和營養(yǎng)支持,而母乳喂養(yǎng)不良的嬰兒在出生后的頭幾年無法獲得這些營養(yǎng)支持。HMO的合成、降解和改性酶可作為嬰兒配方奶粉的補(bǔ)充劑解決這一營養(yǎng)缺失問題,因此這些酶引起了科學(xué)家的研究興趣。

圖片來源:ACS Catal.
雙歧桿菌雙歧乳糖酶(LnbB)是母乳喂養(yǎng)嬰兒腸道微生物群中降解母乳低聚糖的關(guān)鍵酶。近期,Universitat de Barcelona的Carme Rovira課題組在LnbB晶體結(jié)構(gòu)的指導(dǎo)下,利用QM/MM亞動力學(xué)揭示了LnbB催化的分子機(jī)制。

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研究發(fā)現(xiàn),寡糖底物遵循1S3/1,4B → [4E]? →4C1/4H5和4C1/4H5 → [4E/4H5] ? → 1,4B連續(xù)兩個反應(yīng)步驟的構(gòu)象路線,反應(yīng)自由能壘與實驗結(jié)果一致。



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該研究揭示了早期微生物群低聚糖的加工過程,并將有助于LnbB和類似糖苷酶的生物催化工程。
參考文獻(xiàn):Enzymatic Hydrolysis of Human Milk Oligosaccharides. The Molecular Mechanism of Bifidobacterium Bifidum Lacto?N?biosidase
ACS Catal. 2022, 12, 4737?4743
原文作者:Irene Cuxart, Joan Coines, Oriol Esquivias, Magda Faijes, Antoni Planas,Xevi Biarnés, and Carme Rovira*