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網(wǎng)站首頁/有機(jī)動(dòng)態(tài)/實(shí)驗(yàn)與測(cè)試/Angew. Chem. :首例催化叔碳中心立體構(gòu)型翻轉(zhuǎn)的羥化酶
Angew. Chem. :首例催化叔碳中心立體構(gòu)型翻轉(zhuǎn)的羥化酶

天然產(chǎn)物生物合成過程中的羥基化反應(yīng)主要由血紅素依賴的P450氧化酶和α-酮戊二酸依賴的非血紅素氧化酶2-ODOs(2-oxoglutarate / Fe-dependent oxidases)所催化。典型的酶催化羥基化反應(yīng)機(jī)理,由P450卟啉環(huán)中的porphyrin?+-Fe(IV)=O或2-ODOs中的Fe(IV)=O從底物中攫取一個(gè)質(zhì)子形成卟啉Fe(IV)-OH或Fe(III)-OH,隨后遵循經(jīng)典的“羥基回彈”理論,鐵氧物種的羥基自由基(HO?)回彈到底物自由基上,形成羥化產(chǎn)物。迄今為止,所有報(bào)道叔碳中心的酶促羥基化反應(yīng),其立體構(gòu)型都是保持不變的。



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近日,上海中醫(yī)藥大學(xué)林國(guó)強(qiáng)院士團(tuán)隊(duì)賀慶利研究員、趙群飛副研究員與中山大學(xué)佘志剛教授合作,在解析中藥秋茄內(nèi)生真菌Aspergillus sp. SK-28中的環(huán)二肽化合物Brevianamide K的生物合成途徑過程中,發(fā)現(xiàn)首例α-酮戊二酸依賴的氧化酶AspE催化叔碳中心立體構(gòu)型翻轉(zhuǎn)的羥化反應(yīng)。


以3,6-二烯-2,5-二酮哌嗪結(jié)構(gòu)(3,6-diene-2,5-diketopiperazines, 3,6-DE-2,5-DKPs)為核心骨架的天然產(chǎn)物在自然界中廣泛分布,但其在真菌中的生物合成機(jī)制還未被闡明。通過異源表達(dá)和體外生化研究發(fā)現(xiàn),真菌來源Brevianamide K的3,6-DE-2,5-DKP骨架的生物合成途徑與細(xì)菌不同,其在α-酮戊二酸依賴的氧化酶(AspE)和P450酶(AspF)的催化以及隨后的脫水作用下形成了3,6-DE-2,5-DKPs骨架結(jié)構(gòu)。

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有意思的是,α-酮戊二酸依賴的氧化酶AspE催化(+)-Brevianamide V產(chǎn)生(-)-Brevianamide Q,出乎意料,其立體構(gòu)型發(fā)生翻轉(zhuǎn)。通過分子對(duì)接、關(guān)鍵氨基酸突變及同位素喂養(yǎng)實(shí)驗(yàn),作者推測(cè)AspE的Fe(IV)=O從底物中攫取一個(gè)氫原子后形成Fe(III)-OH,底物再轉(zhuǎn)移一個(gè)電子到Fe(III)-OH,形成底物亞胺陽離子中間體和Fe(II)-OH,隨后水分子從反面親核進(jìn)攻實(shí)現(xiàn)了底物構(gòu)型的翻轉(zhuǎn)。

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該工作中首次發(fā)現(xiàn)并提出酶催化的構(gòu)型翻轉(zhuǎn)的羥化機(jī)制,突破了經(jīng)典對(duì)羥化酶“羥基回彈”機(jī)制的認(rèn)知,為設(shè)計(jì)生物合成含有不同手性羥基中心的天然產(chǎn)物提供了新的工具和思路。

文信息

Hydroxylation with Unusual Stereoinversion Catalyzed by an FeII/2-OG Dependent Oxidase and 3,6-Diene-2,5-diketopiperazine Formation in the Biosynthesis of Brevianamide K

Zhuo-Zheng Xu, Zheng Zhuang, Runlin Cai, Guo-Qiang Lin, Zhigang She, Qunfei Zhao, and Qing-Li He


Angewandte Chemie International Edition

DOI: 10.1002/anie.202216989




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