分享一篇發(fā)表在JACS上的文章,題目為Chemoproteomic Identification of Spermidine-Binding Proteins and Antitumor-Immunity Activators。本文通訊作者為京都大學(xué)的Kenji Chamoto教授與Motonari Uesugi教授。Kenji Chamoto課題組致力于研究免疫與腫瘤治療,Motonari Uesugi課題組則致力于發(fā)展具有重要生理功能的活性小分子。
癌癥免疫療法,尤其是程序性細胞死亡蛋白1(PD-1)阻斷免疫療法,由于T細胞免疫功能受損而在老年患者中難以奏效。在此前研究中,作者發(fā)現(xiàn)亞精胺(Spermidine),作為一種隨著衰老而減少的生物多胺,通過直接結(jié)合和激活羥基輔酶A(CoA)脫氫酶亞基α(HADHA),能夠增強脂肪酸氧化(FAO)過程,進而提高線粒體活性和T細胞的殺傷能力,最終改善PD-1療法對老年小鼠的療效。但由于亞精胺除了激活FAO之外還有多方面的調(diào)控作用,且生物穩(wěn)定性較差,因此難以進一步開發(fā)為治療用試劑。在本文中,作者報告了一種基于亞精胺的生物正交探針,用其分析亞精胺結(jié)合蛋白,以及篩選線粒體脂肪酸氧化的小分子增強劑。在探針設(shè)計上,研究人員參考此前SAR的知識,選擇在亞精胺的四碳端進行衍生化改造。首先,作者設(shè)計了進引入炔基的探針1,用其排除了共價調(diào)節(jié)蛋白功能的可能性;隨后,作者進一步引入雙吖丙啶基團,得到探針2,并利用光交聯(lián)捕捉亞精胺的非共價相互作用蛋白。探針2能夠產(chǎn)生濃度依賴性的標(biāo)記,并且與天然的亞精胺之間有明顯競爭作用。對已知靶點HADHA,探針2也能夠產(chǎn)生明顯的富集效果。接下來,作者使用32個亞精胺類似物小分子分別與探針2進行競爭,通過比較競爭前后對HADHA 的富集水平變化,最終發(fā)現(xiàn)化合物13,又被命名為spermimic,在10 μM時即可產(chǎn)生明顯競爭,比天然亞精胺的有效競爭濃度降低了10倍以上。與天然亞精胺一致,該化合物也能夠激活HADHA。作者使用探針2系統(tǒng)鑒定天然亞精胺以及spermimic的結(jié)合蛋白。結(jié)果表明,兩者均有~140種互作蛋白,其中有121種相同蛋白。GO分析表明上述互作蛋白富集于線粒體、細胞核中。選擇選取5個spermimic互作蛋白,并通過探針2競爭標(biāo)記的策略對相互作用實現(xiàn)了驗證。通過測量耗氧率(OCR),作者評估了spermimic對CD8+ T細胞的影響。與亞精胺相似,spermimic增強了備用呼吸能力(SRC),表明其保留了亞精胺增強線粒體生物能的能力。此外,在使用PD-L1 mAb治療的攜帶MC38癌細胞幼鼠模型中,亞精胺與spermimic均可增強抗腫瘤活性。為期九周的實驗表明,與對照組小鼠相比,使用亞精胺/spermimic治療的小鼠均有顯著提高的存活率。綜上所述,本文通過發(fā)展亞精胺的生物正交探針,對亞精胺的蛋白靶點進行了系統(tǒng)鑒定,同時尋找到具有更高成藥前景的小分子spermimic。原文鏈接:https://doi.org/10.1021/jacs.3c14615文章引用:10.1021/jacs.3c14615