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Nature Communications|通過Baylis Hillman反應(yīng)加合物進(jìn)行與位置無關(guān)的蛋白質(zhì)位點特異性偶聯(lián)
分享一篇近期發(fā)表在Nature Communications上的文章,題目為“Location-agnostic site-specific protein bioconjugation via Baylis Hillman adducts”。文章的通訊作者為印度博帕爾科學(xué)教育與研究所的Dimpy Kalia。



蛋白質(zhì)N-末端半胱氨酸(N-Cys)獨特的反應(yīng)性對選擇性蛋白質(zhì)標(biāo)記具有重要意義。此前,作者報道了衍生的Baylis Hillman加合反應(yīng)與1,2-氨基硫醇之間的快速選擇性反應(yīng),以形成雙雜環(huán)支架,并將其用于體外和活細(xì)胞條件下穩(wěn)定的蛋白質(zhì)生物偶聯(lián)。作者將這種蛋白質(zhì)生物偶聯(lián)技術(shù)稱為Baylis Hillman orchestrated protein aminothiol labelling BHoPAL)。此外,作者還報道了一種基于硫辛酸連接酶的技術(shù),用于在蛋白質(zhì)內(nèi)任意位點引入1,2-氨基硫醇部分,使 BHoPAL技術(shù)應(yīng)用不局限于N-Cys,從而與位置無關(guān)。將這種方法與BHoPAL聯(lián)用,生成了雙標(biāo)記的蛋白質(zhì)生物偶聯(lián)物,即在單個蛋白質(zhì)分子的兩個不同特定位點上附加了不同的標(biāo)記(圖1)。



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1. 用于蛋白質(zhì)中1,2-氨基硫醇化學(xué)選擇性生物偶聯(lián)的BHoPALBaylis Hillman orchestrated protein aminothiol labelling)策略。



靛紅衍生的 Baylis HillmanIBH)反應(yīng)已被用作合成復(fù)雜天然產(chǎn)物的支架、醫(yī)藥中間體和臨床藥品的研究,盡管對IBH進(jìn)行了廣泛的研究,但它們與1,2-氨基硫醇的反應(yīng)性尚未報道。作者設(shè)想IBH中有兩個適當(dāng)定位的離去基團(tuán),一個α-乙酸基團(tuán)和一個β-氰基團(tuán),將與1,2-氨基硫醇進(jìn)行兩次連續(xù)的加成-消除反應(yīng),以生成6元環(huán)狀加合物(圖2)。該反應(yīng)將涉及初始硫醇添加,然后消除乙酸鹽以生成中間體 B,然后進(jìn)行分子內(nèi)氮雜-邁克爾加成,然后消除氰基形成2,由于分子內(nèi)2中的烯烴將被鎖定在Z構(gòu)象中,使該反應(yīng)具有高度的Z選擇性(圖 2)。作者合成了N-乙酰的IBH加合物1并在堿性條件在室溫下,在質(zhì)子有機溶劑和非質(zhì)子有機溶劑以及水溶液中反應(yīng),驗證了上述假設(shè)。



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2. 通過IBH加合物介導(dǎo)的1,2-氨基硫醇衍生化合成C=C連接的雙雜環(huán)。



首先,作者用N -酰基IBH加合物1A1B在不同pH條件下用等摩爾量的半胱胺·鹽酸處理,在高pH條件下反應(yīng)的更快(3a)。用烷基取代N -酰基會減慢與N -甲基加合物1c的反應(yīng)。接下來,作者研究了從n -乙酰半胱氨酸(NAC)開始的20種蛋白質(zhì)原氨基酸對1,2氨基硫醇片段的選擇性,均具有不錯的產(chǎn)率(3b), N-甲基加合物1C也得到了類似的結(jié)果?;诎腚装彼岷?/span>1ApH值為67、7.58的水溶液中的反應(yīng)的紫外光譜的動力學(xué)分析,計算出他們的二級速率常數(shù) (3c)。建立了BHoPAL1,2-氨基硫醇的優(yōu)異化學(xué)選擇性。



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3. 水溶液條件下N -?;?/span>/烷基IBH加合物與半胱氨酸的快速定量偶聯(lián)。



接下來,作者使用BHoPAL標(biāo)記蛋白質(zhì)的N-Cys殘基。構(gòu)建了三種N-Cys模型蛋白的,增強型綠色熒光蛋白(eGFP)、麥芽糖結(jié)合蛋白(MBP)mCherry,通過重組生產(chǎn)這些蛋白,將它們?nèi)诤系綗煵菸g刻病毒(TEV)蛋白酶底物肽(ENLYFQC序列)N端,并進(jìn)行TEV蛋白酶裂解(4)。用等量的N -乙酰基IBH加合物1A、1D1EpH 6.5的磷酸鈉緩沖液中處理所得的N-Cys蛋白,通過ESI-MS分析,所有9種蛋白偶聯(lián)物均可得到,產(chǎn)率高達(dá)99%(4)。這些結(jié)果確定了對蛋白質(zhì)內(nèi)部半胱氨酸的N-半胱氨酸的選擇性。作者發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)生物偶聯(lián)物是穩(wěn)定的,并保留了未修飾的前體蛋白的結(jié)構(gòu)和功能特性。這些結(jié)果表明,在溫和的生物相容性條件下,BHoPAL在低試劑濃度下快速定量進(jìn)行,而不會破壞蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能以形成穩(wěn)定的蛋白質(zhì)偶聯(lián)物。



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4. 通過BHoPAL標(biāo)記含N-Cys 的蛋白質(zhì)。



N-Cys
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