甲基化是一種廣泛存在的天然修飾,具有多種調(diào)節(jié)和結(jié)構(gòu)功能,由多種S-腺苷-L-甲硫氨酸(AdoMet)依賴性甲基轉(zhuǎn)移酶(MT酶)進行。AdoMet輔因子由多聚甲硫氨酸腺苷轉(zhuǎn)移酶家族(MAT)從甲硫氨酸(Met)和ATP產(chǎn)生。為了促進機制和功能研究,已經(jīng)開發(fā)了重新利用MAT和MTase反應(yīng)以接受來自相應(yīng)前體的可轉(zhuǎn)移基團的擴展策略。
最近,Vilnius University的Saulius Klimas?auskas課題組通過小鼠MAT2A的結(jié)構(gòu)導(dǎo)向工程,使甲硫氨酸類似物S-(6-疊氮基己基-2-炔基)-L-同型半胱氨酸(N3-Met)能夠生物催化合成擴展的AdoMet類似物Ado-6-疊氮。
圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
同時,三種工程化MAT2A突變體顯示出對擴展類似物的催化能力,并在不存在和存在競爭性Met的情況下能夠與M.TaqI和小鼠DNMT1的工程化突變體的級聯(lián)反應(yīng)中實現(xiàn)DNA衍生化。
圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
隨后,通過使用CRISPR-Cas基因組編輯將兩種工程突變體作為MAT2A-DNMT1級聯(lián)導(dǎo)入在小鼠胚胎干細胞中。在生理水平的Met存在下暴露于N3-Met后,所得細胞系保持正常的生存能力和DNA甲基化水平,并顯示出Dnmt1依賴性的DNA修飾和延伸的疊氮化物標簽。該研究首次證明了一個基因穩(wěn)定的系統(tǒng),用于生物合成生產(chǎn)擴展的AdoMet類似物,這使得能夠在活哺乳動物細胞中溫和地代謝標記DNMT特異性甲基化。
圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
原文標題:Engineered Methionine Adenosyltransferase Cascades for Metabolic Labeling of Individual DNA Methylomes in Live Cells
原文作者:Liepa Gasiule?, Vaidotas Stankevic?ius, Kotryna Kvederavic?iu?te?, Jonas Mindaugas Rims?elis, Vaidas Klimkevic?ius, Graz?ina Petraityte?, Audrone? Ruks?e?naite?, Viktoras Masevic?ius, and Saulius Klimas?auskas*
https://doi.org/10.1021/jacs.4c06529