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J. Am. Chem. Soc. | ?通過泛素鏈的化學多樣化解析其分支結構的編碼信號

分享一篇發(fā)表在JACS上的文章,文章標題“Chemical Diversification of Enzymatically Assembled Polyubiquitin Chains to Decipher the Ubiquitin Codes Programmed on the Branch Structure”,文章的通訊作者是東京大學的Akimitsu Okamoto教授,其課題組主要從事生物聚合物方面的研究。


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泛素分子能夠在不同賴氨酸殘基上多聚化,進而形成異型泛素鏈。泛素鏈的分支結構對于蛋白質降解的精確調節(jié)至關重要。然而,異型泛素鏈的化學功能化仍是一個不小的挑戰(zhàn),這阻礙了對異型泛素鏈功能的系統(tǒng)評估。本文,作者報道了一種酰肼連接策略,實現(xiàn)了非變性條件下泛素鏈的化學多樣化衍生,進而研究了分支結構在泛素介導的生物過程中的關鍵作用。
在泛素分子中添加的化學官能團應當滿足以下條件:不干擾泛素鏈的合成、能在合成過程中穩(wěn)定存在、能夠在非變性條件下很容易地轉化為其它反應性官能團。為此作者將泛素分子C末端改造為酰肼結構。這一結構能夠在溫和的條件下形成親核?;〈磻?/span>的前體。作者首先證明,酰肼結構能夠很好地與酶促組裝合成泛素鏈的方法兼容。進一步,作者測試了C末端的不同化學多樣化,包括引入熒光小分子、DNA鏈以及熒光蛋白等等。
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在此基礎上,作者研究了K63/K48異型鏈在酶促去泛素化中的結構-功能關系。使用熒光素標記不同類型的聚泛素鏈,可以分析泛素鏈在切割過程中的動力學特征。在OTUB1的催化下,K63/K48 Ub2-Mix能夠更快地被切割,這可能與泛素和OTUB1的界面互作相關聯(lián)。而對于另一種去泛素酶AMSH,切割動力學則呈現(xiàn)出不同的特征。
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本文作者:ZF
責任編輯:LYC
原文鏈接:https://doi.org/10.1021/jacs.4c11279
原文引用:DOI: 10.1021/jacs.4c11279




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