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Angew. Chem.: 基于DNA分子計算的晶體管平臺用于癌癥診斷


隨著全球癌癥發(fā)病率的不斷攀升,核酸分析技術(shù)在癌癥的診斷與治療過程中扮演著至關(guān)重要的角色。近年來,眾多研究揭示了微小RNA(miRNA)可以作為潛在的生物標(biāo)志物,通過同時檢測和分析多個miRNA有助于提高癌癥診斷準(zhǔn)確性。然而,目前常見的miRNA檢測方法存在操作復(fù)雜、成本高昂,并且依賴于專業(yè)設(shè)備的問題。因此,開發(fā)一種能夠準(zhǔn)確檢測和邏輯分析多種miRNA標(biāo)志物并在臨床護理點提供即時結(jié)果的癌癥診斷技術(shù)具有迫切需求。

近日,復(fù)旦大學(xué)魏大程教授團隊設(shè)計了一種基于DNA分子計算的晶體管“一站式(one-stop)”診斷平臺,該平臺集成了傳感與計算功能,實現(xiàn)了在單個晶體管芯片上對多個miRNA標(biāo)志物的同時檢測與邏輯分析,提升了癌癥診斷的效率與準(zhǔn)確性。



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該平臺的工作流程包括樣本輸入、檢測與邏輯計算、機器學(xué)習(xí)和結(jié)果輸出四個步驟。首先,平臺以與癌癥相關(guān)的miRNAs作為輸入分子,并將這些分子引入石墨烯場效應(yīng)晶體管(GFET)的反應(yīng)腔室中。隨后,在傳感界面上利用DNA分子計算技術(shù),采用AND和OR邏輯門作為計算單元,執(zhí)行多級布爾運算,生成報告基因。這些報告基因與GFET上的DNA四面體框架結(jié)合,產(chǎn)生電信號響應(yīng)。這一步驟使得平臺能夠在單個晶體管上同時檢測多個輸入分子,降低了成本與操作復(fù)雜性。接著,通過機器學(xué)習(xí)確定最優(yōu)閾值,提高診斷準(zhǔn)確性。最終,根據(jù)電信號和閾值獲得診斷結(jié)果。

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由于高信號轉(zhuǎn)換效率,該平臺即使在分析物濃度降至2×10?16 M時,仍能得到準(zhǔn)確的診斷結(jié)果。在對22例肝細胞癌患者和40例非肝細胞癌患者的血清樣本進行檢測時,該平臺展現(xiàn)出高達98.4%的診斷準(zhǔn)確率。

文信息

DNA Logical Computing on a Transistor for Cancer Molecular Diagnosis

Dr. Derong Kong, Shen Zhang, Xinye Ma, Yuetong Yang, Changhao Dai, Prof. Li Geng, Prof. Yunqi Liu, Prof. Dacheng Wei

該論文的第一單位為復(fù)旦大學(xué)高分子科學(xué)系聚合物分子工程國家重點實驗室。復(fù)旦大學(xué)博士后孔德榮和博士研究生張申為共同第一作者。復(fù)旦大學(xué)魏大程研究員、東方肝膽外科醫(yī)院耿利教授、復(fù)旦大學(xué)博士后孔德榮為共同通訊作者。


Angewandte Chemie International Edition

DOI: 10.1002/anie.202407039



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