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SPIDERTM 鄰近標記 小分子 Pull-Down 試劑盒

一、產(chǎn)品簡介

    鄰近標記技術(shù)已被成功應用于鑒定蛋白靶標,相比傳統(tǒng)的Pulldown/IP+MS技術(shù),鄰近標記技術(shù)可以解決鑒定弱或瞬時相互作用、研究膜蛋白等諸多問題。根據(jù)結(jié)核分枝桿菌類泛素蛋白酶體系統(tǒng)中底物Pup分子在體外能夠招募PafA連接酶發(fā)揮鄰近標記作用的實驗原理,來自上海交通大學的科研團隊研發(fā)了一項基于底物的新型鄰近標記技術(shù)(專利號ZL202110069353.7),命名為Specific Pupyla-tion as IDEntity Reporter(SPIDER)。該技術(shù)可應用于蛋白-蛋白、核酸-蛋白、小分子-蛋白等相互作用的驗證和發(fā)現(xiàn)。

    本試劑盒基于SPIDER鄰近標記技術(shù),僅需準備生物素化標記的誘餌分子,加入待反應樣本(純化蛋白、細胞/組織裂解液)及SPIDER反應體系啟動反應,誘餌分子(Bait)和目標蛋白(Prey)之間的非共價結(jié)合被轉(zhuǎn)化為目標蛋白和鏈霉親和素之間的共價連接,隨后目標蛋白可以被生物素瓊脂糖親和富集并進行質(zhì)譜鑒定。相比其他互作檢測產(chǎn)品,該方法無需提前將標簽和誘餌分子進行融合,擺脫對融合蛋白表達準確性的依賴,操作相對簡單,應用范圍廣。此外,該產(chǎn)品后續(xù)使用嚴苛的條件進行清洗,可顯著降低非特異蛋白的干擾,富集能力強,結(jié)果準確性更高,同時兼具操作簡單快捷的優(yōu)點。

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二、產(chǎn)品應用范圍

用于小分子、重組蛋白的結(jié)合蛋白/靶標蛋白的篩選和發(fā)現(xiàn)

僅適用于體外反應

僅用于科學研究

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四、需要您自行準備的主要試劑、耗材和儀器

1.生物素標記的小分子/重組蛋白

1)生物素標記的小分子/重組蛋白:4rxns共需2.4nmol,建議最小濃度為10 μM; 生物素標記位點盡量在最低程度上影響小分子/蛋白活性。

特別提示:

生物素與小分子/重組蛋白之間需要柔性Linker,建議2~3個PEG,防止重組蛋白影響生物素與鏈霉親和素的結(jié)合,或者生物素影響重組蛋白/小分子表面構(gòu)象與活性。

2)非標記小分子(重組蛋白無需準備):2rxns共需120 nmo,建議最小濃度為1mM。

2.細胞/組織裂解液

4 rxns共需細胞/組織裂解液中總蛋白12 mg,建議最小濃度為1 mg/mL。

特別提示:

細胞裂解時,Cell Lysate Buffer的有效成分建議使用非離子型去污劑,如1%NP-40,其作用溫和,能夠保留蛋白的天然構(gòu)象以及相互作用;酶抑制劑應避免使用AEBSF或帶有AEBSF組分的Cocktai,AEBSF會抑制SPIDER反應。

3.其它需要的主要試劑

Tween 20:共需40 μL,可完成4 rxns。

4.耗材

15 mL離心管,1.5 mL EP管,一次性吸頭。

5.儀器

可用于500xg的微量離心機,以及15mL離心管,500xg的水平離心機;渦旋振蕩器,旋轉(zhuǎn)混勻器(水平混勻器、三維混勻器可作為備選);37℃水浴鍋,4℃冰箱。

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如有需要可聯(lián)系我們:

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