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Nat. Chem. Biol. | 小分子的氧化還原調(diào)控實現(xiàn)應激顆粒的溶解

分享一篇發(fā)表在Nature Chemical Biology上的文章,題目為“Small-molecule dissolution of stress granules by redox modulation benefits ALS models”,通訊作者是來自德國馬克斯·普朗克分子細胞生物學與遺傳學研究所的Richard J. Wheeler研究員和Tony Hyman研究員,研究方向分別是細胞運動與形態(tài)和相分離。


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漸凍癥(ALS)是一種致命的神經(jīng)退行性疾病,主要影響運動神經(jīng)元,導致患者逐漸失去肌肉控制能力,最終因呼吸衰竭而死亡。目前,漸凍癥的治療手段極為有限,僅有兩種藥物獲得FDA批準,但這些藥物無法阻止疾病的發(fā)展。因此,探索新的治療途徑對于改善漸凍癥患者的預后至關重要。此前研究表明許多與家族性漸凍癥相關的突變都發(fā)生在RNA結合蛋白中,如TDP-43和FUS。這些蛋白具有大段的內(nèi)在無序區(qū)域(IDRs),在正常情況下主要定位于細胞核中,參與基因表達調(diào)控和DNA損傷響應。然而,在細胞應激時,它們會被轉運到細胞質中,并與mRNA 等其他分子一起形成應激顆粒。而漸凍癥相關的FUS和TDP-43 突變體則可能導致應激顆粒的異常相變,使得應激顆粒難以在應激解除后溶解,從而將核蛋白困在細胞質中,引發(fā)神經(jīng)退行性病變。在本文中,作者通過篩選發(fā)現(xiàn)硫辛酰胺能抑制蛋白的聚集并改善神經(jīng)退行性疾病。


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首先作者采用了一種基于細胞的篩選方法。他們構建了融合表達GFP的FUS蛋白(FUS-GFP)的 HeLa 細胞系,利用高內(nèi)涵成像策略對 Pharmakon 文庫中的1600個小分子進行了篩選。從中,他們篩選出了能夠顯著減少應激顆粒數(shù)量的47個化合物。隨后,他們又通過低鹽和還原的策略篩選直接影響應激顆粒蛋白的化合物。其中,作者發(fā)現(xiàn)硫辛酰胺能夠在砷酸鹽誘導的情況下顯著的抑制FUS形成應激顆粒。隨后作者又采用N15標記的策略和衍生光交聯(lián)基團的策略驗證了硫辛酰胺在處理時確實能夠進入到細胞內(nèi)部并與應激顆粒共定位。


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接下來,作者合成了一系列與硫辛酰胺相似的化合物來研究構效關系(SAR)。他們發(fā)現(xiàn)硫辛酸的R/S異構體表現(xiàn)出相似的EC50,表明構型的影響較小,而氨基部分轉化為三級胺則會升高EC50。此外,他們也發(fā)現(xiàn)硫辛酰胺中的二硫戊環(huán)是活性所必須的,將其驗證為穩(wěn)定的硫醚則會顯著降低活性,因此他們猜測硫辛酰胺可能是通過氧化還原過程發(fā)揮功能。


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隨后,作者通過TPP實驗探究了硫辛酰胺發(fā)揮功能過程中的直接相互作用蛋白。其中,作者發(fā)現(xiàn)硫辛酰胺和砷酸鹽處理導致 70 種蛋白質的熱穩(wěn)定性顯著增加。通過RNAi的篩選策略,作者發(fā)現(xiàn)富含脯氨酸和谷氨酰胺的剪接因子(SFPQ)以及富含絲氨酸/精氨酸的剪接因子1(SRSF1)的敲低能夠影響硫辛酰胺的功能。


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由于此前研究表明甲硫氨酸的氧化還原狀態(tài)可調(diào)控相分離過程,而作者通過序列分析發(fā)現(xiàn)SFPQ中含有28個甲硫氨酸。因此,作者通過非天然氨基酸插入的方式將SFPQ中的M替換為了非天然氨基酸AHA,結果表明AHA的插入確實會減少應激顆粒的形成,而敲低SFPQ則可挽救這一表型,表明是該蛋白依賴的。最終,作者也證明了谷氨酰胺確實能夠減輕家族性 ALS 模型中的 ALS 表型。

總的來說,作者通過基于細胞的化合物篩選策略發(fā)現(xiàn)硫辛酰胺能夠抑制應激顆粒的形成,并起到改善神經(jīng)退行性疾病的作用。


本文作者:WYQ

責任編輯:MB

DOI:10.1038/s41589-025-01893-5

原文鏈接:https://doi.org/10.1038/s41589-025-01893-5



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