分享一篇發(fā)表在Nature Chemistry上的文章:High-throughput discovery of fluoroprobes that recognize amyloid fibril polymorphs,通訊作者是來自UCSF的Jason E. Gestwicki教授,該課題組的研究興趣是分子伴侶如何維持蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài),并開發(fā)相應的化學探針,揭示分子伴侶如何與疾病相關蛋白質(zhì)相互作用。
Tau是一種內(nèi)在無序的微管結(jié)合蛋白,在神經(jīng)退行性疾病患者的神經(jīng)元內(nèi)組裝成富含β折疊片的原纖維?;颊邅碓吹膖au原纖維具有不同的構(gòu)象,即多晶型物,而且不同疾病中的tau原纖維結(jié)構(gòu)有所差異。目前已經(jīng)開發(fā)了一些研究淀粉樣蛋白原纖維的熒光探針,例如thioflavin T (ThT),當熒光探針與淀粉樣蛋白結(jié)合時,其熒光強度會顯著增加。盡管目前的熒光探針的優(yōu)勢是具有檢測各種原纖維的通用性,但是缺乏對不同原纖維多晶型物的選擇性。
本文作者的目標是建立一個平臺,用于快速發(fā)現(xiàn)構(gòu)象選擇性原纖維結(jié)合熒光探針,作者首先專注于tau蛋白,因為它是原纖維多晶型物,而且野生型和突變的tau(P301S)具有不同的原纖維結(jié)構(gòu)。在進行篩選之前,作者需要獲得足夠的、不同構(gòu)象的tau蛋白。于是作者表達并純化了具有0N4R剪接變體的重組tau(野生型和P301S點突變),然后將這些蛋白質(zhì)與 13種不同的多陰離子混合,在聚集反應中,總共產(chǎn)生了26個原纖維樣品。
在淀粉樣蛋白原纖維的相對疏水性和剛性環(huán)境中,熒光探針的熒光強度通常會顯著增加。因此,作者設想熒光強度將是蛋白質(zhì)自適應差示掃描熒光法(protein-adaptative differential scanning fluorimetry, paDSF)平臺中原纖維結(jié)合的良好指標。paDSF將數(shù)據(jù)分析管道與有機染料集合相結(jié)合,以探測加熱過程中染料和蛋白質(zhì)之間相互作用的變化。因此,作者采用paDSF的平臺進行探針篩選,該平臺包含有高化學多樣性的300多種化學染料。此外,paDSF平臺能夠~2小時內(nèi)完成對~70 μg純蛋白的掃描。
通過該方法,作者篩選到一些分子對原纖維構(gòu)象異構(gòu)體的亞群具有相對特異性,這些分子包括具有香豆素和聚甲基素支架的化合物,而這些化合物尚未應用到淀粉樣蛋白結(jié)合染料領域中。此外,作者還篩選了針對Aβ蛋白、α-突觸核蛋白的熒光探針。
進一步地,作者驗證了其中一個分子L095在成像方面的性質(zhì)。作者在來自阿爾茨海默病患者的腦切片中,利用L095進行染色。成像結(jié)果表明,L095與Aβ斑塊以及tau蛋白聚集物均有結(jié)合,但是兩者是不同的激發(fā)波長:L095在激發(fā)波長為610 nm處與αβ(4G8抗體)共定位,在激發(fā)波長為660 nm處與tau(pS396抗體)共定位,具有可以區(qū)分兩種病理的光譜性質(zhì)。
總而言之,本文作者報道了一種淀粉樣蛋白多晶型選擇性熒光探針的篩選方法,并擴充了探針的工具箱。
本文作者:MB
責任編輯:LZ
DOI:10.1038/s41557-025-01889-7
原文鏈接:https://doi.org/10.1038/s41557-025-01889-7